Para la temporada 2023-24 se renueva a José Bordalás consiguiendo mantener holgadamente la categoría finalizando en el duodécimo puesto con 43 puntos (diez victorias, trece empates y quince derrotas). Las eliminatorias se reanudaron en el año 2009, en su undécima y duodécima fecha la selección presentó dos empates consecutivos de local frente a Brasil y Paraguay quienes con esos partidos ya estaban clasificados, si bien logró conseguir puntos, dichos resultados peligraban la clasificación de la selección, ya que la posicionaban en la séptima posición de la tabla, no obstante en su decimotercera y decimocuarta fecha la selección presentaría dos victoria consecutivas de visitante frente a Perú en Lima y de local frente a Argentina en Quito, dichos resultados colocaban a la selección en el quinto puesto de la clasificación, después le tocaría enfrentar a Colombia en Medellín en su decimoquinta fecha donde perdería por 2-0, lo que ponían en peligro su clasificación, sin embargo en la decimosexta fecha en su visita en La Paz ante Bolivia la selección obtendría otra victoria, lo que la colocaba y garantizaba que la selección estuviera en el puesto 4 de clasificación con dos fechas de anticipación, al mismo tiempo que sus rivales cercanos en la clasificación: Venezuela, Colombia y Uruguay.
Hasta el final de la temporada 2020-21 sería el conjunto local de la afición arlequinada. 3-0 en la vuelta como local. Con varios cambios de técnico, que terminaron con Alberto López como entrenador del primer equipo se logró la permanencia en la categoría de plata en la temporada 2013/2014 en los últimos minutos de la última jornada en un épico partido frente al Real Jaén con gol de Guzmán Casaseca. Debido a las obras de remodelación del Estadio de la Cerámica, el club disputó cuatro de las seis primeras jornadas fuera de casa, cosechando dos triunfos, un empate y tres derrotas en esos partidos, lo que llevó a la sustitución del entrenador, dando entrada a Javi Calleja. El tercer entrenador de la temporada fue Javi Calleja, camisetas de futbol replicas que dio un aire fresco a la plantilla y consiguió resucitar a un equipo muerto. Fueron los mejores años del equipo alicantino. La Real Sociedad consideraba que dos de los tres jugadores ingleses en la alineación del Athletic (Sloop y Martin) no cumplían el requerimiento federativo de llevar dos años residiendo en España. Desde el Aston Vila llegan dos camisetas Match Worn del recién balón de oro al mejor portero, el ‘Dibu’ Martínez y del internacional español, Pau Torres.
Cinco minutos después el goleador ecuatoriano de las eliminatorias pasadas, Agustín Delgado, aprovechó un despeje mal anticipado de un defensor boliviano, para que solo con el guardameta José Carlo Fernández, el Tin levante el balón y la introduzca en las redes. La temporada 2010/11, año del XC Aniversario del club, tras un arranque de liga inmejorable con 8 partidos invicto, el Alavés se proclamó campeón de invierno de su grupo, siendo además el equipo más goleador de toda la Segunda División B, sin embargo, la buena racha se truncó a mitad de la segunda vuelta, clasificándose finalmente en la 3.ª posición. En medio de esta incertidumbre, el Granada, realizó una rebaja de sueldo a sus futbolistas y cuerpo técnico, y un ERTE a los demás empleados del club, con el objetivo de suavizar el golpe económico. La temporada 1981/82 precedió a la Copa del Mundo de España 82. La Liga comenzó con retraso por la segunda huelga de futbolistas en la historia del fútbol español.
En honor a sus cien años de historia, el Alavés sacó más como una baraja de naipes Fournier conmemorativa con los rostros de sus jugadores más ilustres, un cupón de la ONCE con la fecha fundacional, un sello de Correos, un libro, un pack de mus o una camiseta conmemorativa con la que jugaron contra el Valladolid el 5 de febrero de 2021. Al final de la temporada se publicó un documental llamado 2000 Pasos que narra el siglo de historia del equipo con entrevistas a algunas de sus grandes leyendas. Allí mismo se empecinó con plasmar sobre la camiseta blanca la franja verde de palmeras que recorría y vertebraba la ciudad. Tras una primera vuelta muy irregular, fue destituido dejando al equipo 14° en la clasificación, pero a tan solo 2 puntos sobre el descenso y tras perder 3-1 contra el Cádiz. Aun así, la remodelación más importante fue en la temporada 1998/99 tras el tercer ascenso del Alavés a Primera División. También algunos jugadores del Getafe C.F. Además llegaron al primer equipo jugadores que serían la base para los próximos éxitos, como Ricardo Arias o Enrique Saura, procedentes del filial, y los fichajes del paraguayo Lobo Diarte, Ángel Castellanos, José Carrete y Botubot, este último en el mercado de invierno.